Вот неполный список, возможно не очень точный, ибо взят с одного ресурса и составлен в 2009 году. Многих команд ещё не хватает... Но тенденция, думаю, понятна...
ФК «Асмарал» Москва Основан в 1978 году, 1999 - расформирован.
ФК «Балаково» Балаково Основан в 1993 году, 2003 - расформирован.
«Балтика-Тарко» Калининград — Исключен из ПФЛ 22 марта 2005
ФК «Бештау» Лермонтов Основан в 1992 году, 2000 - расформирован.
«БСК» Спирово — Исключен из ПФЛ 31 января 2005
ФК «Венец» Гулькевичи Основан в 1989 году, 2003 - расформирован.
«Витязь» Крымск — Исключен из ПФЛ 14 апреля 2005
«Диана» Волжск — 1993—2002
ФК «Динамо» Омск Основан в 1923 году, 2001 - расформирован.
ФК «Динамо» Пермь Основан в году, - расформирован.
ФК «Динамо» Тула Основан в 1995 году, 2003 - расформирован.
«Жемчужина» Будённовск — Исключен из ПФЛ 22 марта 2005
ФК «Иртыш» Тобольск Основан в 1991 году, 2000 - расформирован.
«Искра» Энгельс — Исключен из ПФЛ 22 февраля 2006
ФК «Кристалл» Смоленск Основан в 1992 году, 2003 - расформирован.
ФК «Кузбасс-Динамо» Кемерово Основан в 1946 году, 2003 - расформирован.
ФК «Локомотив» Абакан Основан в 1968 году, 2002 - расформирован.
«Локомотив» Нижний Новгород — Исключен из ПФЛ 22 февраля 2006(теперь играет на первенство города- прим.)
«Локомотив» Санкт-Петербург — Исключен из ПФЛ 24 мая 2005
(теперь как ДЮСШ играет на первенство города- прим.)
ФК «Льнянщик» Кострома Основан в 1999 году, 2001 - расформирован.
ФК «Медик» Газопровод Основан в 2000 году, 2003 - расформирован.
«Металлург- Метизник» Магнитогорск — Исключен из ПФЛ 21 марта 2006
ФК «Нарт» Черкесск Основан в 1982 году, 2004 - расформирован.
ФК «Немком» Краснодар Основан в 2000 году. В 2003-соединился с командой ФК «Витязь» Крымск в команду ФК «Немком» Крымск.Затем снова стал самостоятельным. После чего влился в ФК «Кубань» Краснодар и перестал существовать.
ФК «Нефтяник» Ярославль Основан в 1994 году, 2002 - расформирован.
«Нижний Новгород» Нижний Новгород — Исключен из ПФЛ 26 февраля 2007
«Нефтяник» Уфа — Исключен из ПФЛ 9 февраля 2006
ФК «Оазис» Ярцево Основан в 1997 году, 2001 - расформирован.
«Псков-2000» Псков — Исключен из ПФЛ 1 сентября 2005
«Сатурн» Набережные Челны — Исключен из ПФЛ по итогам 2005 года
ФК «Светогорец» Ленинградская Область (Светогорск) Основан в 2000 году. 2004 - расформирован.
ФК СКА Санкт-Петербург Основан в 1937 году, 2002 - расформирован.
«СКД» Самара — 1946—1995
ФК «Спартак-Телеком» Шуя Основан в 1991 году, 2004 - расформирован.
ФК «Спартак-Чукотка» Москва Основан в 1998 году, 2001 - расформирован.
«Тобол» Курган — Исключен из ПФЛ 24 января 2006
ФК «Торпедо-Алттрак» Рубцовск, 2003 - расформирован.
ФК «Торпедо-Виктория» Нижний Новгород Основан в 1932 году, 2002 - расформирован.
ФК «Уралан плюс» Москва Основан в 1997 году, 2003 - расформирован.
ФК «Энергия» Чайковский Основан в 1991 году, 2002 - расформирован.
ФК «Югра» Нижневартовск Основан в 1994 году, 2002 – расформирован
«Юджин» Самара — 1990—1994
ФК «Асмарал» Москва Основан в 1978 году, 1999 - расформирован.
ФК «Балаково» Балаково Основан в 1993 году, 2003 - расформирован.
«Балтика-Тарко» Калининград — Исключен из ПФЛ 22 марта 2005
ФК «Бештау» Лермонтов Основан в 1992 году, 2000 - расформирован.
«БСК» Спирово — Исключен из ПФЛ 31 января 2005
ФК «Венец» Гулькевичи Основан в 1989 году, 2003 - расформирован.
«Витязь» Крымск — Исключен из ПФЛ 14 апреля 2005
«Диана» Волжск — 1993—2002
ФК «Динамо» Омск Основан в 1923 году, 2001 - расформирован.
ФК «Динамо» Пермь Основан в году, - расформирован.
ФК «Динамо» Тула Основан в 1995 году, 2003 - расформирован.
«Жемчужина» Будённовск — Исключен из ПФЛ 22 марта 2005
ФК «Иртыш» Тобольск Основан в 1991 году, 2000 - расформирован.
«Искра» Энгельс — Исключен из ПФЛ 22 февраля 2006
ФК «Кристалл» Смоленск Основан в 1992 году, 2003 - расформирован.
ФК «Кузбасс-Динамо» Кемерово Основан в 1946 году, 2003 - расформирован.
ФК «Локомотив» Абакан Основан в 1968 году, 2002 - расформирован.
«Локомотив» Нижний Новгород — Исключен из ПФЛ 22 февраля 2006(теперь играет на первенство города- прим.)
«Локомотив» Санкт-Петербург — Исключен из ПФЛ 24 мая 2005
(теперь как ДЮСШ играет на первенство города- прим.)
ФК «Льнянщик» Кострома Основан в 1999 году, 2001 - расформирован.
ФК «Медик» Газопровод Основан в 2000 году, 2003 - расформирован.
«Металлург- Метизник» Магнитогорск — Исключен из ПФЛ 21 марта 2006
ФК «Нарт» Черкесск Основан в 1982 году, 2004 - расформирован.
ФК «Немком» Краснодар Основан в 2000 году. В 2003-соединился с командой ФК «Витязь» Крымск в команду ФК «Немком» Крымск.Затем снова стал самостоятельным. После чего влился в ФК «Кубань» Краснодар и перестал существовать.
ФК «Нефтяник» Ярославль Основан в 1994 году, 2002 - расформирован.
«Нижний Новгород» Нижний Новгород — Исключен из ПФЛ 26 февраля 2007
«Нефтяник» Уфа — Исключен из ПФЛ 9 февраля 2006
ФК «Оазис» Ярцево Основан в 1997 году, 2001 - расформирован.
«Псков-2000» Псков — Исключен из ПФЛ 1 сентября 2005
«Сатурн» Набережные Челны — Исключен из ПФЛ по итогам 2005 года
ФК «Светогорец» Ленинградская Область (Светогорск) Основан в 2000 году. 2004 - расформирован.
ФК СКА Санкт-Петербург Основан в 1937 году, 2002 - расформирован.
«СКД» Самара — 1946—1995
ФК «Спартак-Телеком» Шуя Основан в 1991 году, 2004 - расформирован.
ФК «Спартак-Чукотка» Москва Основан в 1998 году, 2001 - расформирован.
«Тобол» Курган — Исключен из ПФЛ 24 января 2006
ФК «Торпедо-Алттрак» Рубцовск, 2003 - расформирован.
ФК «Торпедо-Виктория» Нижний Новгород Основан в 1932 году, 2002 - расформирован.
ФК «Уралан плюс» Москва Основан в 1997 году, 2003 - расформирован.
ФК «Энергия» Чайковский Основан в 1991 году, 2002 - расформирован.
ФК «Югра» Нижневартовск Основан в 1994 году, 2002 – расформирован
«Юджин» Самара — 1990—1994









